60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_11460 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  100 
 
 
258 aa  469  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  60.91 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  55.81 
 
 
269 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  51.3 
 
 
304 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  48.28 
 
 
261 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.43 
 
 
266 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  48.25 
 
 
265 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  51.01 
 
 
255 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  53.59 
 
 
245 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  52.83 
 
 
262 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  49.24 
 
 
257 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.17 
 
 
264 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 
261 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  45.15 
 
 
261 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  47.29 
 
 
263 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  47.18 
 
 
279 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  56.25 
 
 
257 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  53.91 
 
 
263 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  46.4 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.64 
 
 
261 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  46.72 
 
 
266 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  40.87 
 
 
275 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.86 
 
 
258 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.66 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  47.86 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.86 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  41.26 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.86 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.53 
 
 
259 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  45.3 
 
 
261 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  46.88 
 
 
257 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  38.98 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.19 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  36.94 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 
360 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 
367 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 
339 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.73 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.3 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.33 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
250 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
306 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24 
 
 
375 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.04 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
363 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 
367 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 
366 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
371 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  27.88 
 
 
917 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>