83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2379 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  100 
 
 		 274 aa  520  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  63.37 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  68.09 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  68.36 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  65.62 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  63.67 
 
 		 258 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  63.67 
 
 		 258 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  67.58 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  45.17 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.13 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  47.64 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  43.46 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  47.33 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  44.79 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  43.02 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  45.88 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  47.03 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  45.23 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  47.29 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.22 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  42.4 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  44.49 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  42.16 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.86 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.31 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  46.64 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  41.32 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  41 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  33.6 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  34.68 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.09 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 375 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  26.78 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  29.66 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  28.06 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  21.34 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.76 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0506  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  24.17 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  22.32 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  18.61 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.58 
 
 		 356 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 290 aa  42  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>