84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5163 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  66.52 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  54.4 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  53.36 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  52.34 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 		 304 aa  181  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  47.28 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  51.57 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  50.2 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  47.33 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  47.29 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.83 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  48.03 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  48.83 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.83 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  51.35 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  46.72 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  47.62 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  49 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  46.67 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  49.4 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  46 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  49 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.53 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.52 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  42.69 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  46.8 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  39.17 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  50.89 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  47.08 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  47.03 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.69 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  24.78 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.72 
 
 		 356 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 338 aa  48.9  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 413 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  27.44 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.78 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  31.67 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.78 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 375 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  24.34 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  24.34 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 247 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  31.21 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  26.54 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  24.35 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.26 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.26 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 360 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  28.04 
 
 		 281 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 		 358 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  30.88 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 266 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 298 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 286 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 280 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>