274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0091 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  100 
 
 		 253 aa  494  1e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.95 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.95 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.15 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.39 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.87 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.18 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.76 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.91 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.47 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25.73 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.17 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.16 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  24.07 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.07 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  24.02 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.27 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  26.05 
 
 		 285 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  25.93 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.94 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.45 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.67 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  26.67 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  25.82 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  25.82 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  25.82 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.73 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  25.43 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.55 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  25.7 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  24.88 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  26.22 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  23.88 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  24.03 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  26.97 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3849  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.33 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  29.32 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  23.14 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  22.67 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  24.68 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  22.67 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  24.21 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  25 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  27.65 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.62 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  26 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  25.14 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  30.06 
 
 		 376 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  25 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  25 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>