190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6993 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 268 aa  524  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.01 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.28 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1053  ABC-2 type transporter  54.93 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.66 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  27.27 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  24.84 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.77 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 378 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 379 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 383 aa  53.1  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 378 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 440 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  23.92 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 368 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 398 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  25 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  28.77 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  25 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  25 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  27.35 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 390 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  25.73 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.57 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 384 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 370 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  30.43 
 
 		 370 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 370 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 370 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.71 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  26.9 
 
 		 375 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 373 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  25 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 		 391 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  23.53 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 391 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  26.06 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  26.06 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.12 
 
 		 384 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  26.06 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  26.06 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  26.06 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 377 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  25.21 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.95 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 387 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 427 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 377 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>