48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3952 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 268 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.36 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.43 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 407 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 395 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.34 
 
 		 431 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  24.02 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 440 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  31.79 
 
 		 281 aa  52.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  33.11 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 396 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 408 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  31.29 
 
 		 403 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  24 
 
 		 373 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  22.09 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  22.7 
 
 		 379 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1053  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 98 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  24.07 
 
 		 381 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  22.54 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  24.64 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.67 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  23.46 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  22.84 
 
 		 381 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  24.07 
 
 		 381 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  21.08 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  27.01 
 
 		 374 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  25.34 
 
 		 252 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  23.98 
 
 		 241 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>