130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4131 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 396 aa  754    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  44.6 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  42.53 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  40.85 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  40.43 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  40.97 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.87 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  19.44 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  19.36 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  21.95 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  19.53 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.94 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  19.59 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  30 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.42 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  21.89 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  25.9 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  26.67 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.46 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  26.65 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.45 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.87 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  20.91 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  34.09 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  19.22 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  20.99 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  22.17 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 358 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.58 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  19.84 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  24.46 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.28 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  18.84 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  30.61 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.17 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 268 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.65 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  21.67 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  22.41 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.17 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25.74 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  19.75 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  21.32 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  23.68 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.37 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  20.69 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  23.68 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 247 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  20.21 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 260 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 339 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  22.88 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  26.04 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  25.71 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  19.84 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  25.7 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.12 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  24.44 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  30.29 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  25.65 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  28.42 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>