96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1643 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1643  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 366 aa  731    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1716  ABC-2 type transporter  95.08 
 
 		 366 aa  700    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0382  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1584  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1411  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  26.54 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.71 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  24.13 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  22.19 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.65 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  19.94 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  22.32 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  21.41 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  23.85 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  24.24 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  24.24 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  24.24 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  24.24 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  24.24 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.88 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  19.73 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  19.88 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  24.6 
 
 		 942 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.11 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  23.81 
 
 		 928 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  19.59 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.18 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  21.68 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  21 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  21.68 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  22.57 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  21.79 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  21.26 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  20.36 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  20.6 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  21.69 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  23.89 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  23.33 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  20.55 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  25.29 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.73 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  20.33 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  22.98 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.71 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  22.67 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.67 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  19.42 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  27.93 
 
 		 904 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  23.21 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>