130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1842 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  792    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  50.13 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  48.05 
 
 		 382 aa  358  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  50.13 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  41.3 
 
 		 397 aa  305  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  42.89 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  39.74 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  40.89 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  40.89 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  40.21 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  40.1 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  39.39 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  39.95 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  40.55 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  39.23 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  39.83 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  39.79 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  38.2 
 
 		 382 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 496 aa  180  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  31.49 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 780 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  25.95 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  29.19 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  27.61 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  24.59 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  24.59 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  23.08 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  22.6 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  21.89 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  24.25 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  27.45 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  25.08 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  27.23 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  20.89 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  27.01 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  21.3 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  26.45 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  21.9 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  28.4 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  28.93 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  24.01 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  27.27 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  22.12 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25.45 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  25.84 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  21.27 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  24.31 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  23.57 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.59 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  23.69 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  23.69 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  21.24 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  22.06 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.18 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  25.16 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  26.88 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  20.7 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  20.93 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 373 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  21.35 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  19.88 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  21.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  24.92 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  22.15 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  19.54 
 
 		 366 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  24.71 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.77 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  23.94 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  22.31 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  22.15 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  23.49 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1023  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>