78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0714 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 332 aa  651    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  20.32 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.33 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.11 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  21.23 
 
 		 366 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  25.77 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.59 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  23.85 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.26 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.86 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.72 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  24 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.35 
 
 		 261 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  21.01 
 
 		 381 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  23.46 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  20.89 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  28.65 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25.34 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  26.16 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.54 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  22.87 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.54 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  22.87 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  22.87 
 
 		 381 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  22.87 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  20.37 
 
 		 380 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.89 
 
 		 249 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  19.08 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.92 
 
 		 254 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 367 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0440  hypothetical protein  28.71 
 
 		 220 aa  42.7  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.108532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>