24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2111 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1560  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.367161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1779  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.496998  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0432  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1100  ABC-2 type transporter  36.23 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00425239  hitchhiker  0.00015918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 		 257 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25.23 
 
 		 257 aa  45.1  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15960  ABC-2 transporter, permease component  36.11 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 376 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 375 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  26.28 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 251 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 271 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1211  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 251 aa  41.6  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0428455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>