14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0432 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0432  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1560  ABC-2 type transporter  56.5 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.367161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1100  ABC-2 type transporter  44.31 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00425239  hitchhiker  0.00015918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1969  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000398406  hitchhiker  0.000000000710377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0220  ABC-2 type transport system, membrane protein  31.6 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0612371 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2151  ABC-2 type transport system, membrane protein  28.65 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.148287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  31.07 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  39.13 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1779  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 254 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.496998  normal  0.210099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>