24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0475 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 
222 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 
270 aa  92  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 
253 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1430  hypothetical protein  31.22 
 
 
280 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.0390822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5082  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1560  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.367161  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 
276 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28460  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.91 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  23.23 
 
 
255 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.79 
 
 
232 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30630  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.86 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 
375 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
366 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.75 
 
 
267 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.24 
 
 
243 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
267 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>