13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1100 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1100  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00425239  hitchhiker  0.00015918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1560  ABC-2 type transporter  45.53 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.367161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0432  ABC-2 type transporter  44.31 
 
 		 246 aa  175  8e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1678  hypothetical protein  36.54 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30630  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.7 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.14 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 247 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>