11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0220 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0220  ABC-2 type transport system, membrane protein  100 
 
 		 241 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0612371 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1969  ABC-2 type transporter  73.33 
 
 		 241 aa  341  8e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000398406  hitchhiker  0.000000000710377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2151  ABC-2 type transport system, membrane protein  75.42 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.148287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1079  ABC-2 type transporter  67.5 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0486058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1211  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0428455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0908  conserved hypothetical protein  29.72 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000484468  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0349  hypothetical protein  29.22 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1779  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.496998  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0173  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00869778  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1474  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0432  ABC-2 type transporter  31.29 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>