100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0567 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0567  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 331 aa  651    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1035  ABC-2 type transporter  49.85 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.89 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.48 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.73 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30.46 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.99 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.53 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 260 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 271 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.47 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  25.14 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  19.16 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  25.96 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  27.71 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.77 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.26 
 
 		 253 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  26.9 
 
 		 255 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  26.9 
 
 		 255 aa  45.8  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.85 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  25.12 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  25.12 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.36 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  28.12 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  24.64 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  25 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  25 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  24.64 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  27.78 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  25 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 274 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 		 286 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.63 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  22.28 
 
 		 232 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 254 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  43.1 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 271 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>