110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1035 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1035  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 333 aa  641    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0567  ABC-2 type transporter  49.85 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.32 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  20.53 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.45 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  20.43 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  20.99 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  29.35 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  29.35 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  29.35 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  29.85 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  30 
 
 		 249 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  26.44 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.86 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  30.73 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  28.78 
 
 		 249 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.62 
 
 		 356 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  31.46 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 233 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  25.24 
 
 		 265 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  29 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.28 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  22.75 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  22.93 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 272 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.04 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.62 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  26.32 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  23.34 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  18.84 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 253 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  19.17 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 231 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.39 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  25 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0638  multidrug ABC transporter permease  42.11 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.490558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  28.91 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  23.3 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  20.23 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  25.18 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  23.19 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  22 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  19.7 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  23.64 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 273 aa  43.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>