34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0723 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0723  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.394403  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1419  hypothetical protein  33.45 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3239  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.236946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0668  cylB protein  27.17 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2063  hypothetical protein  25.7 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  37.36 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  32 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  22.75 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  22.94 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 370 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.35 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  22.35 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  22.35 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  22.94 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  22.94 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  22.94 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  22.94 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  22.35 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  22.35 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 373 aa  42.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  24.72 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 367 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>