19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1930 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1930  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 282 aa  553  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  33.93 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  33.93 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  36.04 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  36.04 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.43 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.88 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  26.87 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1602  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.863835  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.17 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>