11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0988 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0988  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0698  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3025  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.019296 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0330  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3260  hypothetical protein  25.87 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2274  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1336  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  25.76 
 
 		 276 aa  48.5  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0869  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.201874  normal  0.150559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>