60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0119 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  509  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  67.05 
 
 
259 aa  349  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  58.08 
 
 
262 aa  311  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  58.62 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  56.86 
 
 
262 aa  299  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  52.11 
 
 
273 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  52.11 
 
 
273 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  55.6 
 
 
262 aa  295  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  54.79 
 
 
262 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  44.79 
 
 
265 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  44.79 
 
 
265 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  50.38 
 
 
262 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  47.88 
 
 
265 aa  225  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  47.49 
 
 
265 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  38.31 
 
 
264 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  42.02 
 
 
265 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  37.84 
 
 
264 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  38.22 
 
 
264 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  38.61 
 
 
263 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  32.71 
 
 
267 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  31.56 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  31.7 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  35.23 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  29.92 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  32.89 
 
 
265 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  31.32 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  29.23 
 
 
265 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  25.4 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  27.23 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  26.1 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  23.44 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  25.63 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  29 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  25.6 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  22.05 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  27.2 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  22.71 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  24.04 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  26.46 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  23.17 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  22.66 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  20.44 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  25.23 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  20.23 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  20.23 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  26.74 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  21.88 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  29.05 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  20.99 
 
 
258 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  24 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  29.8 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  21.03 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  31.37 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  27.03 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  25.87 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  25.87 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  28.65 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>