71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0487 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  79.47 
 
 
263 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  66.92 
 
 
263 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  66.92 
 
 
263 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  66.92 
 
 
263 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  67.3 
 
 
263 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  66.92 
 
 
263 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  66.92 
 
 
263 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  66.92 
 
 
263 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  66.92 
 
 
263 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  66.16 
 
 
263 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  65.64 
 
 
259 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  66.54 
 
 
263 aa  360  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  28.06 
 
 
268 aa  118  9e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  29.63 
 
 
259 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  30.8 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  26.24 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
272 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  27.38 
 
 
262 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  24.02 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  27.27 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  25.1 
 
 
295 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  27.51 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  26.77 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.95 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  24.9 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  27.24 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  25.23 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.57 
 
 
267 aa  85.1  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  25.55 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  29.19 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  24.54 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  26.2 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  26.64 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  24.62 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  26.05 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.39 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  21.59 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  25.85 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  27.07 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  28.48 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  25.86 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  27.85 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  26.32 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  22.73 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  26.16 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  26.16 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  26.01 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  24.71 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  24.63 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  27.57 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  25.13 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  22.1 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  26.06 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  23.28 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  22.96 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  24.86 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  26.37 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  23.66 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  22.39 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  26.61 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.95 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  25.23 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  22.76 
 
 
265 aa  48.9  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  22.39 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  25.25 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  18.68 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  18.68 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  24 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  26.56 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  26.56 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>