53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2072 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  100 
 
 		 278 aa  523  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  74.09 
 
 		 289 aa  367  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  68.71 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  71.07 
 
 		 280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  36.12 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  34.91 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  29.67 
 
 		 266 aa  129  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  30.4 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  33.46 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  34.91 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.94 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  27.86 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  32.13 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  30.65 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.77 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  27.17 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  27.1 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  32.65 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  32.65 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  29.81 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  34.62 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  27.92 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  26.69 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  26.69 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  26.69 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  26.69 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  26.69 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  28.78 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  25.98 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  33.46 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  25.94 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  25.29 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  24.15 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  19.22 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  19.57 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  22.97 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  29.13 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  29.75 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  26.29 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  23.5 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  27.13 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  22.86 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  23.71 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  24.49 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  27.13 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  19.9 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  26.6 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  27.39 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  28.57 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>