79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3151 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
273 aa  522  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  69.69 
 
 
267 aa  350  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  64.48 
 
 
264 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  54.94 
 
 
264 aa  248  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  41.31 
 
 
295 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  42.48 
 
 
261 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  41.15 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  42.47 
 
 
284 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  43.53 
 
 
257 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  41.9 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  38.35 
 
 
266 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  37.55 
 
 
311 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  32.81 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  30.98 
 
 
268 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  30.45 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  25.1 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  27.52 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  26.98 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  31.32 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  26.32 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  28.92 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  28.79 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  25.9 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  23.89 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  23.48 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  23.48 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  23.48 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  23.48 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  23.48 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  23.48 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  33.85 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  22.27 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  32.57 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  32.97 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  27.31 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  27.27 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  32.64 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  30.57 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  25.5 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  32.25 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  30.32 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  30.32 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  22.08 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  24.26 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  30.32 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  18.22 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  22.88 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  27.33 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  23.79 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  23.79 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  30.04 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  28.34 
 
 
259 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  25.97 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  24.61 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  25.65 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  21.08 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.72 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  24.9 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  19.25 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  28.86 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  29.8 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  21.52 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  19.49 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  26.22 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  27.6 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  21.81 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  29.58 
 
 
261 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  19.13 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  28.67 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  30 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  28.76 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  28.67 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  20.94 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  22.37 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  25.41 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  17.19 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>