60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0428 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
265 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  98.49 
 
 
265 aa  500  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  97.74 
 
 
265 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  72.45 
 
 
265 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  41.23 
 
 
262 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  32.6 
 
 
267 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  32.09 
 
 
262 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  32.61 
 
 
262 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  32.47 
 
 
262 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.37 
 
 
262 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  31.58 
 
 
257 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  28.14 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  28.14 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  29.92 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  30.45 
 
 
259 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  31.32 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  29.81 
 
 
265 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  29.81 
 
 
265 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  26.56 
 
 
262 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  32.55 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  30.94 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  26.15 
 
 
264 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  30.57 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  25.77 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  25.38 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  25.39 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  31.09 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  26.22 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  23.51 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  24.91 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  26.32 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  28.92 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  24.74 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.58 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  26.05 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.48 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  25.78 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  28.68 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  28.68 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  26.35 
 
 
299 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  28.04 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  32.12 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  22.63 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  26.02 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  22.26 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  28.28 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  28.65 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  25.31 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  21.76 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  28.11 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  28.76 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  26.58 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  27.43 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  20.57 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  30.26 
 
 
266 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  28.07 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  30.34 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  19.32 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  27.56 
 
 
266 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  27.7 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>