83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  100 
 
 		 267 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  69.69 
 
 		 273 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  54.2 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  61.22 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  45.1 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  45.25 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  41.35 
 
 		 295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  44.96 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  42.91 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  41.22 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  38.64 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  34.47 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  36.43 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  29.3 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  27.38 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  31.55 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  26.32 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  25.37 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  29.57 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  31.18 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  31.72 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  33.33 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  28.7 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  26.24 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  23.66 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  24.19 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  23.66 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  23.66 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  23.66 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  22.16 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  30.92 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  28.36 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  23.56 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  24.08 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  22.7 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  24.6 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  30.65 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  31.54 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  17.78 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  22.08 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  29.58 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  27.83 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  22.51 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  26.13 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  30.05 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  22.78 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  22.18 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  22.18 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  20.11 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  27.17 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.29 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  25.45 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  30.09 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.07 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  23.18 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  25.4 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  19.78 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  20.15 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  24.79 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  25.65 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  26.29 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  17.53 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  23.33 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  23.79 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  25.64 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  22.95 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  22.42 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  25.64 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  28.65 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  29.05 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  22.13 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  28.18 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  30.08 
 
 		 265 aa  45.4  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  21.95 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  21.94 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  26.98 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  28.05 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>