70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  100 
 
 		 264 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  54.2 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  54.94 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  53.79 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  43.85 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  35.85 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  38.02 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  39.92 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  39.71 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  36.74 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  37.84 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  34.96 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  36.19 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  29.48 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  27.95 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  26.05 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  28.57 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  29.65 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  26.14 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  25.75 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  24.45 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  34.24 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  26.96 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  25.37 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  24.89 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  27.14 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  32.58 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  30.53 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  24.45 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  30.65 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  27.12 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  23.64 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  29.39 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  30.48 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  25.13 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  20.89 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  20.85 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  31.02 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  23.74 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  29.33 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  29.89 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  29.89 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  32.95 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  22.27 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  23.99 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  23.99 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  23.23 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  32.23 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  23.44 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  30.86 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  32.23 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  30.53 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  30.53 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  34.58 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  23.64 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  23.25 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  26.47 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  23.17 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  33.04 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  29.7 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  25.77 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>