74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4779 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  100 
 
 		 266 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  47.35 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  47.74 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  47.27 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  42.86 
 
 		 311 aa  158  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  41.04 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.64 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.67 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  35.96 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  35.66 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  38.35 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  40.07 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  34.08 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  27.88 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  27.88 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  27.8 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  27.31 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  25.83 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  25.84 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  26.02 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  34.55 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  25.4 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  25.93 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  33.21 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  25.4 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  25.4 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  25.4 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  25.4 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  27.09 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  25.33 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  25.13 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  22.34 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  24.06 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  28.57 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  24.77 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  23.74 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  23.74 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  30.43 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  24.81 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  22.65 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  27.86 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  28.49 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  28.49 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  28.27 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  29.26 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  21.39 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  31.77 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  22.73 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  19.56 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  24.54 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  28.57 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  32.29 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  21.74 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  31.06 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  27.07 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  22.11 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  30.89 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  29.32 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  24.6 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  24.6 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  29.09 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  24.55 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  23.02 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  26.32 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.4 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  23.36 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  23.36 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>