76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2652 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  487  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  26.79 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 
263 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  25.94 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  26.32 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  26.32 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  26.32 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  26.32 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  26.32 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  28.57 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  26.54 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  25.85 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  28.04 
 
 
262 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  29.01 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  30.05 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  25.75 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  24.03 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  27.75 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  24.74 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  24.74 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  26.06 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  25 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  24.21 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  22.01 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  23.76 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  22.51 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  22.69 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  24.86 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  23.28 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  23.14 
 
 
262 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  20.85 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  26.07 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  23.44 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  23.53 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  23.6 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  22.78 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  24.21 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  25.56 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  27.49 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  24.04 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  23.3 
 
 
270 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  22.26 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  22.35 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  24.31 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  24.56 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  24.56 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  24.59 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  26.73 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  27.73 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  21.97 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  21.31 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  23.32 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.36 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.4 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  32.46 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  20.25 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  29.49 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  22.95 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  28.23 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  21.83 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  26.89 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  23.11 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  29.05 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  21.78 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  21.7 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  24.6 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  19.62 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  19.62 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  26.97 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  24.23 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  24.23 
 
 
265 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  21.89 
 
 
284 aa  42  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>