66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3779 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  59.69 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  48.84 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  46.51 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  35.82 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  32.08 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  36.23 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  32.32 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  30.08 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.38 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  28.41 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  26.98 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  29.1 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  27.48 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  26.24 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  25.1 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  24.71 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  27.8 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  27.89 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  24.71 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  24.71 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  24.71 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.57 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  24.89 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  26.92 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  25.48 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  24.62 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  27.56 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  27.03 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  28.72 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  26.14 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  25.76 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  26.52 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  28.04 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  27.27 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  23.76 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  32.73 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  24.9 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  24.32 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  24.32 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  25.19 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  25.19 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  24.62 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  30.5 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  21.63 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  26.92 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  18.85 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  25.37 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  20.99 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  22.37 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  22.22 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  24.52 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  26.79 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  31.71 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  22.22 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  21.67 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  23.46 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  24.61 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  21.67 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.11 
 
 		 262 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>