63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0546 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
268 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  29.55 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  31.45 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  28.11 
 
 
262 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  27.21 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  22.61 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  32.21 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  28.19 
 
 
262 aa  92  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  32.58 
 
 
265 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  29.72 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  23.48 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.89 
 
 
262 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  31.73 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  28.92 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  30 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  27.56 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  25.84 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  25.84 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  32.14 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  26.91 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  23.6 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  26.91 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  23.29 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  30.59 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  22.86 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  22.09 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  20.48 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  20.88 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  30.28 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  24.8 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  24.8 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  25.19 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  26.04 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  27.27 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  25.6 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  23.27 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  24.86 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  27.06 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  26.89 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  28.82 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  25.14 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  26.88 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  24.6 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  24.56 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  24.56 
 
 
263 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  19.27 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  28.86 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  21.34 
 
 
251 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  31.79 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  29.05 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.53 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  24.87 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  23.08 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  27.03 
 
 
311 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  27.44 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  20 
 
 
272 aa  45.4  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  23.81 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  20 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  22.92 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  23.48 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  24.88 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>