57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6485 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  46.72 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  42.91 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  41.35 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.02 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  37.88 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  43.89 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  40.23 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  35.66 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  34.47 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  35.66 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  35.71 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  34.09 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  27 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  27.48 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  26.19 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  27.6 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  26.2 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  24.19 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  31.72 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  26.98 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  26.49 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  28.48 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  27.84 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  27.14 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  27.62 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  27.31 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  27.14 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  27.14 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  27.14 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  26.67 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  27.63 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  26.19 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  26.82 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  32.43 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  25.64 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  29.27 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  23.44 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  28.57 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  27.43 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  27.43 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  26.99 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  25.52 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  24.43 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  21.67 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  34.18 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  23.42 
 
 		 270 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  18.33 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4688  putative ABC transporter permease protein  29.84 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.45 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  19.55 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  24.55 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>