76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0979 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  33.98 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  26.89 
 
 
259 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  26.24 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  29.59 
 
 
266 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  27.65 
 
 
272 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 
272 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  26.44 
 
 
263 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.55 
 
 
267 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  27.1 
 
 
270 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  22.52 
 
 
268 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  25.29 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  25.29 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  25.29 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  25.39 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  26.97 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  25.29 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  25.29 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  25.29 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  25.29 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  25.29 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  24.9 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  30.98 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  25.91 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  24.05 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  26.3 
 
 
266 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  27.76 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  24.9 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.05 
 
 
264 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3779  hypothetical protein  27.89 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000120477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  25.52 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  27.88 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3917  protein of unknown function DUF990  28.5 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  25.94 
 
 
251 aa  79  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6485  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  26.2 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  25.54 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  22.99 
 
 
267 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  22.32 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  24.63 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  22.17 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  26.98 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4135  putative membrane protein (DUF990 family)  25 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.992989  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  21.89 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  23.53 
 
 
284 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  23.31 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  24.42 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  24.42 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  25.59 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  21.43 
 
 
286 aa  59.3  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  22.56 
 
 
267 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  28.65 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  28.65 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  22.83 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  24.18 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  24.18 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0137  protein of unknown function DUF990  23.64 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  27.66 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  21.9 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1506  protein of unknown function DUF990  21.28 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  20.44 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  28.93 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  23.18 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2072  putative ABC transporter permease protein  24.1 
 
 
278 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100677  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  24.15 
 
 
265 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  23.63 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  23.63 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  25.82 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.65 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  22.75 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5808  putative ABC transporter permease protein  27.66 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  20.99 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  32.38 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1068  putative ABC transporter permease protein  23.84 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  23.63 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  23.2 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>