76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0894 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  518  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  28.83 
 
 
269 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  22.61 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2521  protein of unknown function DUF990  25.46 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  24.81 
 
 
299 aa  85.5  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  23.25 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  25 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  21.29 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  26.32 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  26.97 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  23.23 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  24.54 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  25.22 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0174  putative ABC transporter, permease protein  25.2 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0171  ABC transporter, permease protein, putative  25.2 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  22.85 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  25.9 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  25.9 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  25.9 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  25.9 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  25.9 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  25.9 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  25.9 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  25.9 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  25.9 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  26.69 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  22.1 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  25.64 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0912  protein of unknown function DUF990  24.35 
 
 
286 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  21.81 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  24.22 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  24.22 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  25 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  22.62 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0449  hypothetical protein  26.26 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  21.69 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  22.31 
 
 
262 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4779  protein of unknown function DUF990  23.11 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  23.6 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0423  protein of unknown function DUF990  24.5 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  24.72 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  24.72 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  22.57 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  24.46 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  24.46 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  26.09 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  24.53 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  25.69 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  22.71 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  21.91 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  18.99 
 
 
272 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  27.66 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  23.53 
 
 
295 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  25.76 
 
 
264 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  25.45 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  25 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  25 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.64 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  24.41 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  23.77 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  21.09 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  25.54 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1829  hypothetical protein  22.95 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  20.16 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  23.44 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  22.95 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  23.4 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  24.32 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2221  protein of unknown function DUF990  21.21 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.894224  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  23.08 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3438  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  24.14 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  25.09 
 
 
262 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  21.03 
 
 
261 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  22.06 
 
 
267 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>