67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0235 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 
265 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 
265 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2556  putative multidrug efflux ABC transporter  66.42 
 
 
265 aa  353  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2210  putative multidrug efflux ABC transporter  65.28 
 
 
265 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29111  putative multidrug efflux ABC transporter  64.53 
 
 
265 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  57.98 
 
 
264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.182602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  59.53 
 
 
264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0982  putative multidrug efflux ABC transporter  59.14 
 
 
264 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.820284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  57.03 
 
 
263 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2683  putative ABC-2 type transport system permease protein  49.01 
 
 
262 aa  258  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144995  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  48.84 
 
 
262 aa  254  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2498  protein of unknown function DUF990  48.25 
 
 
262 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2820  protein of unknown function DUF990  48.43 
 
 
259 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.43925  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  44.79 
 
 
261 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3038  protein of unknown function DUF990  44.53 
 
 
273 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3082  protein of unknown function DUF990  44.53 
 
 
273 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1283  protein of unknown function DUF990  42.31 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  43.63 
 
 
262 aa  210  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3449  hypothetical protein  44.36 
 
 
262 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2513  protein of unknown function DUF990  35.14 
 
 
262 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000318044  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1442  protein of unknown function DUF990  27.24 
 
 
267 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0399  ABC transporter, inner membrane subunit  29.32 
 
 
265 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0428  protein of unknown function DUF990  29.81 
 
 
265 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4172  ABC transporter, inner membrane subunit  29.1 
 
 
265 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.185851  normal  0.064397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0427  protein of unknown function DUF990  30.22 
 
 
265 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  27.45 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2320  protein of unknown function DUF990  28.15 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2349  protein of unknown function DUF990  27.49 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.65923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0546  protein of unknown function DUF990  25.84 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3394  hypothetical protein  26.92 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0685632  hitchhiker  0.000000209532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  26.2 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0894  hypothetical protein  24.72 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3536  hypothetical protein  33.63 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  26.23 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3865  hypothetical protein  21.3 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0435  hypothetical protein  24.02 
 
 
270 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2520  protein of unknown function DUF990  25.27 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0486  hypothetical protein  26.13 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.277876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  26.91 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0537  protein of unknown function DUF990  26.74 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0551  hypothetical protein  26.74 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0660  hypothetical protein  26.32 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4153  hypothetical protein  26.26 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.64 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09770  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.09 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0979  hypothetical protein  23.63 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4788  putative ABC transporter, permease protein  22.01 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.218607  hitchhiker  0.000222628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0589  putative ABC transporter, permease protein  21.64 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  28.3 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3151  protein of unknown function DUF990  28.67 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0588  ABC transporter, permease protein, putative  21.64 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1359  protein of unknown function DUF990  25.97 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3567  hypothetical protein  21.9 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1129  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like protein  25.91 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000681549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0538  putative ABC transporter, permease protein  21.64 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0444  ABC transporter permease  21.27 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0455  hypothetical protein  22.51 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0501  ABC transporter permease  21.27 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0440  ABC transporter permease  21.27 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0533  ABC transporter permease  21.27 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.902364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0487  protein of unknown function DUF990  26.56 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0516  putative ABC transporter, permease protein  21.27 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000460852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0525  hypothetical protein  21.84 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.916517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2491  protein of unknown function DUF990  25.69 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000222283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0443  putative ABC transporter permease protein  27.87 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2674  hypothetical protein  32.05 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0396714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2652  hypothetical protein  24.23 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>