80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2520 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  42.75 
 
 
270 aa  245  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  31.94 
 
 
261 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  31.56 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
261 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 
261 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  31.18 
 
 
261 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  31.18 
 
 
261 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  31.18 
 
 
261 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  31.18 
 
 
261 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
261 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  29.28 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  31.15 
 
 
261 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  29.62 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  31.42 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  31.03 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  29.32 
 
 
265 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  27.86 
 
 
258 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  28.29 
 
 
267 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  27.86 
 
 
258 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  28.02 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  28.41 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  27.06 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  28.12 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.37 
 
 
263 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  20.63 
 
 
278 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  24.44 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  22.3 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  26.64 
 
 
262 aa  87  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  22.13 
 
 
265 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  26.57 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  24.72 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  26.64 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  23.81 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  24.02 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  24.51 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  23.71 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  24.07 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.14 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  25.88 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  20.93 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  20.93 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  19.85 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  23.02 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  21.59 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  21.25 
 
 
281 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  23.72 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  23.72 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  23.76 
 
 
270 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  25.41 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  26.4 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  26.01 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  21.8 
 
 
262 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  22.51 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  21.12 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  32.67 
 
 
165 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  23.11 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  21.79 
 
 
272 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  20.69 
 
 
260 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  23.89 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  27.59 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  25.85 
 
 
277 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  22.68 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1965  protein of unknown function DUF990  26.53 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000288504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  20.97 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  20.85 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  20.3 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  28.3 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  28.3 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  22.87 
 
 
260 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  21.28 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  22.22 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  22.48 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  24.88 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  30.21 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  21.17 
 
 
262 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10531  putative multidrug efflux ABC transporter  29.13 
 
 
264 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  23.37 
 
 
262 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>