77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1067 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  78.65 
 
 
267 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  79.32 
 
 
271 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  82.4 
 
 
267 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  38.26 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  33.33 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  37.45 
 
 
261 aa  171  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  40.08 
 
 
265 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  30.83 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  34.96 
 
 
267 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  33.2 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  36.14 
 
 
278 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.87 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  34.87 
 
 
269 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  35.18 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  41.05 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.96 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  31.4 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  32.66 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  31.27 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  29.06 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  32.33 
 
 
267 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  28.92 
 
 
267 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  22.96 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  24.07 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  22.43 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  25.28 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  26.67 
 
 
261 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  24.16 
 
 
261 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  24.16 
 
 
261 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  24.16 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  24.16 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  24.16 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  24.16 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  24.16 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  22.43 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  22.1 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  23.42 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  25.48 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  28.17 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  28.17 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  22.14 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.33 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  24.44 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  27.6 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  24.69 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  27.11 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  28.95 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  22.56 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  23.53 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  26.5 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  24.56 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  24.56 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  24.86 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  24.86 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  29.35 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.62 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  25.99 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  24.55 
 
 
260 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  25 
 
 
260 aa  52.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  20.11 
 
 
262 aa  52  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  27.1 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  24.35 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  31.05 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  26.07 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  23.77 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  28.33 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  26.97 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  25.85 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  28.02 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  21.4 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  33 
 
 
165 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  18.84 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  24.79 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  24.19 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>