71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09760 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  100 
 
 		 261 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  49.61 
 
 		 267 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  43.87 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  46.09 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  39.45 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  36.22 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  36.82 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  32.3 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  34.25 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  36.08 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  31.75 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  35.5 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  32.67 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  26.54 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  31.5 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  27.95 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  35.8 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  28.52 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  26.36 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  29.41 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  23.17 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  27.59 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  24.41 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  27.49 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  27.17 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  25.38 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  25.38 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  21.59 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  25.38 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  25.38 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  25.38 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  25.38 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  27.67 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  25.38 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  25.38 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  25.38 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  24.62 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  22.69 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  22.52 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  28.35 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  21.65 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.7 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  22.69 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  22.69 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  26.12 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  22.87 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  21.01 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.59 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  24.32 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  21.46 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  21.48 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  21.67 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  23.9 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  26.59 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  23.9 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  25.1 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  23.02 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1187  hypothetical protein  24.89 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  20.16 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  23.85 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  25.5 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  28.43 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  23.11 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  21.88 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  21.88 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  23.28 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  22.18 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  25.71 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  24.77 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>