73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2348 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  31.06 
 
 
262 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  29.37 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.2 
 
 
261 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  29.81 
 
 
260 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  30.26 
 
 
260 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  29.56 
 
 
260 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  30.6 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  28.2 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  28.2 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  27.21 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  26.2 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  26.94 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  26.2 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  24.44 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  29.84 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  28.73 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  26.79 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  24.8 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  28.14 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  25.76 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  27.76 
 
 
260 aa  89  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  25.86 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  27.78 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  24.71 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  27.38 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  25.55 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  24.35 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  23.69 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  25.2 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  23.57 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  25 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  20.47 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  20.47 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  20.47 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  23.37 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  20.47 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  22.86 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  20.08 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  20.08 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  20.08 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  20.08 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  20.08 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  20.91 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  20.08 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  20.08 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  27.78 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  25.65 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  25.45 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  22.04 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  25 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  23.76 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  19.77 
 
 
261 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  25.28 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.29 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  23.28 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  22.51 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  25.09 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  27.35 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  23.24 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  26.16 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  22.14 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  25.65 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  23.38 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  22.82 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  23.4 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  22.3 
 
 
267 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  22.27 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  22.27 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  24.91 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  24.42 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  22.85 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>