89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0173 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  97.72 
 
 		 263 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  44.87 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.82 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  38.46 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  36.92 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  36.54 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  36.15 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  36.15 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  36.15 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  36.15 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  36.54 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  36.54 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  31.03 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  28.95 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  28.95 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  33.33 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  31.77 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  30.89 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  29.46 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  28.46 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  28.97 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  24.52 
 
 		 258 aa  89  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  23.77 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  25.54 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  26.29 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  27.34 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  23.66 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  23.66 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  22.05 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  22.05 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  24.24 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  24.89 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  21.67 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  22.09 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  25.93 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  26.32 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  24.02 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  22.99 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  24.32 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  23.85 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  23.85 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  25.21 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  22.43 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  25 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  24.34 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  24.02 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  23.25 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  22.98 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  21.72 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  21.48 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  23.57 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  22.43 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  24.43 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  20.66 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  35.64 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  21.89 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  25.11 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  19.25 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  19.25 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  21.62 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  23.14 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  20.85 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  22.14 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  24.24 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  21.98 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  24.91 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  25.34 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  21.25 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  22.22 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  21.82 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  21.13 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  23.95 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  20.45 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  22.93 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  23.1 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  22.04 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  24.89 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  20.95 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  22.22 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  22.14 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  22.53 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0119  hypothetical protein  25.87 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>