65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0892 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  27.21 
 
 
270 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  23.46 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  22.22 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  25.76 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  23.66 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  25 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  22.52 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  22.52 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  25.9 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  24.72 
 
 
262 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  24.9 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  24.9 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  22.52 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  25.76 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  23.51 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  25.95 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  25.29 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  21.8 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  20.99 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  24.05 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  22.69 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  22.14 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  24.51 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  24.51 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  24.51 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  24.51 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  24.51 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  25.09 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  24.12 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  26.1 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  23.64 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  24.72 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  23.61 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  20.37 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  25.75 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  22.22 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  25.56 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  23.08 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  25.74 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  26.59 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  24.06 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  26.21 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  24.38 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  22.22 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  23.64 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  21.17 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  21.4 
 
 
315 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  22.54 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  23.55 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  21.08 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  24.62 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  24.04 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  22.46 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  23.08 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  21.65 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  21.95 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  20.11 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  20.33 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  20.35 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  22.22 
 
 
260 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>