69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1830 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  38.26 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  36.88 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  38.61 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  35.61 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  39.02 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  32.95 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  31.4 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  29.73 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.3 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  33.21 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  31.82 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  34.51 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  32.45 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  29.8 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.11 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  29.32 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  32.3 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  27.95 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  31.8 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  29.89 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  27.24 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  28.85 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  28.62 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  27.8 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  27.1 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  28.29 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  27.91 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.19 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  26.34 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  26.54 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  26.54 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  26.54 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  26.54 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  26.54 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  26.15 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  26.59 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  26.54 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  24.22 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  25.54 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  29.18 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  25.11 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.86 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  24.9 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  24.9 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  29.17 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  22.44 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  25.57 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  21.85 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  22.96 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  23.55 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  26.04 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  22.64 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  22.9 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  21.59 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  25.65 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  23.96 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  20.93 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  26.04 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  21.65 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  21.65 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  24.77 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  21.96 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  25.48 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  25.74 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09021  putative multidrug efflux ABC transporter  24.28 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0235  putative multidrug efflux ABC transporter  24.28 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>