64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2386 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  44.02 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  48.26 
 
 
267 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  41.83 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  41.67 
 
 
315 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  33.86 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  36.25 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  33.47 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  35.89 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  32.66 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  28.85 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  29.1 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  28.29 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.26 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  26.59 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  27.56 
 
 
258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  33.87 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  28.24 
 
 
249 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  30.54 
 
 
272 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.5 
 
 
261 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  33.06 
 
 
267 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  25.29 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  26.56 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  26.88 
 
 
267 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  30.95 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  30.95 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  25.39 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  25.39 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  25.39 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  25.39 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  25.39 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  25.39 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  23.72 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  22.53 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  24.71 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  25.37 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  19.85 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  24.25 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  26.88 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  22.37 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  22.22 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  21.18 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  25.29 
 
 
260 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  22.48 
 
 
267 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  24.07 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  19.62 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  25.56 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  24.11 
 
 
265 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  21.92 
 
 
267 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  19.81 
 
 
277 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  19.84 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  26.69 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  25.29 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  23.35 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  26.24 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  20.1 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  21.98 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  21.98 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  21.03 
 
 
264 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  24.06 
 
 
270 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>