74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3437 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  52.47 
 
 
278 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  53.61 
 
 
267 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  45.77 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  41.83 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  36.51 
 
 
267 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  35.63 
 
 
267 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  36.2 
 
 
265 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  36.98 
 
 
269 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  35.18 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  37.16 
 
 
271 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  29.23 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  28.85 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  33.47 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  30.04 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.67 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  35.97 
 
 
267 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.51 
 
 
266 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  27.67 
 
 
258 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  36.19 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  27 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  27 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  27 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  27 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  27 
 
 
261 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  27 
 
 
261 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  27 
 
 
261 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  27 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  27 
 
 
261 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  26.24 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  28.85 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  26.88 
 
 
261 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  26.88 
 
 
261 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  24.51 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  25.94 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.59 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  28.85 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  25.37 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  24.25 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  25.19 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  26.84 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  24.26 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.33 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  23.37 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  23.37 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  16.48 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  25.11 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  25.63 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  23.78 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  23.72 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  25.64 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  25.67 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  20.8 
 
 
264 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  19.18 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  23.94 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  20.63 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  21.19 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  24.08 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  25.8 
 
 
262 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  26.75 
 
 
262 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  20.8 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  21.53 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  21.89 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  22.17 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  20.17 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  22.8 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  20.63 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  20.63 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  21.23 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  19.47 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  23.47 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  29.53 
 
 
262 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>