81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1964 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  100 
 
 
262 aa  520  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  76.72 
 
 
262 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  39.69 
 
 
262 aa  198  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  35.5 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  36.26 
 
 
262 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  38.17 
 
 
260 aa  176  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  33.97 
 
 
262 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  33.97 
 
 
262 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  37.4 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  35.5 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  34.63 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  37.45 
 
 
260 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  34.83 
 
 
260 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  36.64 
 
 
259 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  30.15 
 
 
264 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  35.25 
 
 
262 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  35.25 
 
 
262 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  30.53 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  34.46 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  30.53 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  34.73 
 
 
262 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  34.69 
 
 
260 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  29.01 
 
 
277 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  33.21 
 
 
262 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  33.97 
 
 
262 aa  151  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  34.23 
 
 
259 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  32.58 
 
 
260 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  25.68 
 
 
261 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  26.89 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  33.21 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  28.21 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  27.48 
 
 
262 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  25.48 
 
 
262 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  24.44 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  25.09 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  25.51 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  22.52 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  25.51 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  25.51 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  25.51 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  25.51 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  25.51 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  25.51 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  26.34 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  23.77 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  25.09 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  24.21 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  23.22 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  24.15 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  25.48 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  26.04 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  20.43 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  21.48 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  26.51 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  23.97 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  25.79 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  25.35 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  27.38 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  23.08 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  26 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  26.74 
 
 
278 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  22.44 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  23.4 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  22.68 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  22.56 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  22.56 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.56 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  23.97 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  26.87 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  24.07 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1758  hypothetical protein  24.04 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  19.07 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0177  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  23.3 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  28.95 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  24.47 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  24.55 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  23.37 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  23.01 
 
 
272 aa  42  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>