84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1285 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  81.67 
 
 
261 aa  413  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  44.62 
 
 
263 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  43.82 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  33.07 
 
 
261 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  33.2 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  33.62 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  33.2 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  33.2 
 
 
261 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  33.2 
 
 
261 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 
261 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 
261 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  32.8 
 
 
261 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  32.8 
 
 
261 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  32.4 
 
 
261 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  32.64 
 
 
261 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  31.82 
 
 
261 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  29.8 
 
 
265 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  29.8 
 
 
265 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  28.37 
 
 
279 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  29.84 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  26.34 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  28.19 
 
 
265 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  28.02 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  28.89 
 
 
258 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  27.59 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  27.97 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  30.84 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  23.14 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  30.88 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  23.66 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  26.01 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  28.44 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  24.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  24.3 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  28.7 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  24.71 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  23.45 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  24.77 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  26.99 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  24.09 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  24.4 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  28.07 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  25.33 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  26.92 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  23.81 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  25.4 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  26.34 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  27.6 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  25.4 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  22.4 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  23.02 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  22 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  22.4 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  22.57 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  25.4 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  23.41 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  23.05 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.7 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  24.02 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  22.71 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  21.29 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  26.39 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  25.29 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  24 
 
 
262 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  21.2 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  21.4 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  22.37 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  21.69 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  22.27 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  24.73 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  23.33 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  31.07 
 
 
165 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  22.05 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.31 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  20.94 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  20.08 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  24.55 
 
 
272 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  22.58 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  24.72 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  21.11 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  22.46 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>