68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2675 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  59.44 
 
 		 258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  51 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  49.8 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  31.5 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  33.2 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  29.8 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  32.55 
 
 		 271 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  28.46 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  28.85 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  25.9 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  27.06 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  29.52 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  33.98 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  27.09 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.86 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  27.34 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  24.6 
 
 		 315 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  25.91 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  23.11 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  25 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.27 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  26.39 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  25.58 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  28.97 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  21.51 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  21.77 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  21.37 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  22.58 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  22.18 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  24.76 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  24.09 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  24.09 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  25.7 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  24.51 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  21.34 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  24.77 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  22.49 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  19.92 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  27.31 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  27.31 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  21.09 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  23.83 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  22.66 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  22.27 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  21.69 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  22.27 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  21.91 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  21.64 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  24.77 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  19.9 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  23.39 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  21.43 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  21.4 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  22.18 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  27.52 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  19.12 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  21.51 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  23.39 
 
 		 262 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  21.62 
 
 		 270 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>