71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3778 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  55.43 
 
 		 258 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  52.33 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  51 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  32.93 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  31.3 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  29.73 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  30.83 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  32.8 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  27.86 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  27.34 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  27.31 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  31.2 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  25.1 
 
 		 278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  27.91 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  28.79 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  28.79 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  26.59 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  26.42 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  25.1 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  25.33 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.31 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  22.05 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  25.1 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  23.66 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  24.52 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  24.9 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  25.95 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  22.39 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.94 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  22.39 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  21.62 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  22.39 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  22.39 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  22.01 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  22.39 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  22.39 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  22.69 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  22.39 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  22.31 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  22.48 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  26 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  23.66 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  24.52 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  25 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  23.31 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  23.31 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  24.7 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  23.44 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  22.68 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  20.16 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  19.31 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  19.54 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  23.7 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  20.75 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  21.15 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  20.75 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  20.45 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  23.25 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  20.75 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  20.6 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  21.26 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  25.79 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  18.7 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  25.79 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  18.39 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  21.59 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  19.7 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>