39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2550 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  100 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  32.08 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 261 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  39.45 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  30.86 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  39.45 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  39.45 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  39.45 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  39.45 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  35.71 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  32.67 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  33.66 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  36.63 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  35.64 
 
 		 263 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  34.26 
 
 		 265 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.07 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  32.67 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  34.38 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  27.19 
 
 		 270 aa  47.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  36.79 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  35.29 
 
 		 261 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  33.02 
 
 		 262 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  37.33 
 
 		 267 aa  44.3  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  29.29 
 
 		 260 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  33.66 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  33 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  47.06 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  28.57 
 
 		 261 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  32.39 
 
 		 262 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  32.39 
 
 		 262 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  39.73 
 
 		 260 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  32.67 
 
 		 262 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  33.66 
 
 		 262 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  31.78 
 
 		 269 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>