70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0886 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  498  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  69.11 
 
 
259 aa  314  7e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  61.24 
 
 
260 aa  293  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  56.59 
 
 
262 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  56.59 
 
 
262 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  57.36 
 
 
260 aa  281  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  54.26 
 
 
260 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  57.75 
 
 
260 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  55.04 
 
 
260 aa  271  7e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  55.81 
 
 
260 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  51.92 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  49.62 
 
 
262 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  49.62 
 
 
262 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  53.82 
 
 
262 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  40.77 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  40.38 
 
 
264 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  40 
 
 
264 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  40.77 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  43.94 
 
 
262 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  49.23 
 
 
262 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  36.64 
 
 
262 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  38.64 
 
 
262 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  37.64 
 
 
261 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  34.85 
 
 
261 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  39.02 
 
 
262 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  34.48 
 
 
262 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  38.24 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  36.8 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  29.85 
 
 
277 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  24.06 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  30.04 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  27.52 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  25.94 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  24.52 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  24.06 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  24.06 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  24.44 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  25.2 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  23.68 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  23.68 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  23.68 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3864  hypothetical protein  25.59 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  24.45 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  24.81 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  22.64 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  22.14 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2653  hypothetical protein  21.5 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  25.33 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0913  protein of unknown function DUF990  25 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  26.89 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  23.66 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  27.17 
 
 
267 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  28.46 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  23.31 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  25.94 
 
 
278 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  22.75 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  28.65 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3531  protein of unknown function DUF990  24.6 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  20.97 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  22.58 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  28.46 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  28.46 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  18.39 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  22.31 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  47.06 
 
 
165 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  22.64 
 
 
267 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>